Kinder
Aus ihrer dritten Ehe mit Alfonso von Aragon:
Rodrigo (1499–1512)
Aus ihrer vierten Ehe mit Alfonso I. d’Este:
Tochter, totgeboren 5. September 1502
Alessandro (geboren und gestorben im Jahr 1505)
Ercole II. d’Este (1508–1559), Herzog 1534 ∞ 1528 Renée de France (1510–1575) Tochter des Königs Ludwig XII.
Ippolito II. d’Este (1509–1572), Kardinal 1538
Alessandro d’Este (* April 1514, † 10. Juli 1516)
Eleonora d’Este (* 3. Juli 1515, † 15. Juli 1575), Nonne
Francesco d’Este (* 1. November 1516, † 22. Februar 1578) Fürst von Massa ∞ 1540 Maria di Cardona († 1563) (Haus Folch de Cardona)
Isabella Maria (geboren und gestorben im Jahr 1519)